Antarmuka B-DNA dan DNA Mimic Foldamers

Abstrak
Unit penghubung dirancang dan disintesis yang dapat berfungsi baik sebagai putaran jepit rambut dalam dupleks DNA dan titik jangkar untuk foldamer heliks aromatik yang meniru bentuk dan sifat permukaan B-DNA. Metode dikembangkan untuk mensintesis molekul chimeric alami/non-alami yang menggabungkan foldamer dan segmen DNA. Kemampuan penghubung untuk memposisikan heliks foldamer dan DNA dupleks sehingga tepi dan alurnya berada dalam register, meskipun sifat kimianya sangat berbeda, ditunjukkan dengan menggunakan difraksi sinar-X kristal tunggal, dikroisme melingkar, dan model molekuler. Interferometri bio-lapisan mengonfirmasi bahwa dupleks DNA jepit rambut buatan mempertahankan kemampuannya untuk mengikat protein pengikat DNA. Molekul chimeric dapat membuka jalan bagi penghambat kompetitif interaksi protein-DNA yang melibatkan protein pengikat DNA selektif sekuens.